Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkceP16054 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PrkceP16054 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkceP16054 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkceP16054 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms