Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr4a1P12813 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms