Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtcP11725 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtcP11725 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtcP11725 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtcP11725 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtcP11725 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtcP11725 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtcP11725 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtcP11725 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtcP11725 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtcP11725 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
OtcP11725 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtcP11725 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtcP11725 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtcP11725 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtcP11725 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtcP11725 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtcP11725 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtcP11725 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtcP11725 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtcP11725 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtcP11725 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OtcP11725 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtcP11725 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtcP11725 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtcP11725 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtcP11725 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtcP11725 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtcP11725 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtcP11725 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OtcP11725 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtcP11725 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtcP11725 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtcP11725 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtcP11725 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OtcP11725 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtcP11725 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtcP11725 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtcP11725 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtcP11725 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtcP11725 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtcP11725 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtcP11725 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtcP11725 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtcP11725 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtcP11725 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtcP11725 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OtcP11725 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtcP11725 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OtcP11725 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtcP11725 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtcP11725 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtcP11725 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtcP11725 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtcP11725 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtcP11725 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtcP11725 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtcP11725 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtcP11725 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtcP11725 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtcP11725 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtcP11725 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtcP11725 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtcP11725 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
OtcP11725 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtcP11725 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtcP11725 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtcP11725 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtcP11725 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtcP11725 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtcP11725 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtcP11725 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtcP11725 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtcP11725 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtcP11725 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtcP11725 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms