Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga5P11688 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga5P11688 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga5P11688 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga5P11688 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga5P11688 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga5P11688 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms