Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fv4P11370 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fv4P11370 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fv4P11370 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fv4P11370 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fv4P11370 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fv4P11370 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fv4P11370 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fv4P11370 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fv4P11370 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fv4P11370 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms