Protein–RNA interactions for Protein: P10855

Ccl3, C-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl3P10855 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl3P10855 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl3P10855 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms