Protein–RNA interactions for Protein: P10287

Cdh3, Cadherin-3, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh3P10287 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh3P10287 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms