Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Amd1P0DMN7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Amd1P0DMN7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms