Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb2P0C1T1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb2P0C1T1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms