Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc8P09025 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms