Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms