Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01649 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01649 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01649 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01649 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01649 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01649 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01649 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01649 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01649 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01649 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01649 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01649 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01649 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01649 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01649 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01649 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01649 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01649 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01649 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01649 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01649 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01649 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01649 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01649 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01649 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01649 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01649 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01649 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01649 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01649 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01649 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01649 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01649 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01649 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01649 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01649 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P01649 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01649 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01649 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01649 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01649 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P01649 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P01649 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01649 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01649 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01649 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01649 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01649 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms