Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms