Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lancl1O89112 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms