Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CpdO89001 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CpdO89001 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CpdO89001 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CpdO89001 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CpdO89001 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CpdO89001 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CpdO89001 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CpdO89001 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CpdO89001 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CpdO89001 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CpdO89001 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CpdO89001 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CpdO89001 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CpdO89001 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CpdO89001 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CpdO89001 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CpdO89001 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CpdO89001 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CpdO89001 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CpdO89001 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CpdO89001 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CpdO89001 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CpdO89001 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CpdO89001 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CpdO89001 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CpdO89001 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CpdO89001 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CpdO89001 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CpdO89001 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CpdO89001 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CpdO89001 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CpdO89001 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CpdO89001 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CpdO89001 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CpdO89001 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CpdO89001 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CpdO89001 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CpdO89001 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CpdO89001 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CpdO89001 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CpdO89001 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CpdO89001 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CpdO89001 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CpdO89001 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CpdO89001 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CpdO89001 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CpdO89001 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CpdO89001 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CpdO89001 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CpdO89001 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CpdO89001 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CpdO89001 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CpdO89001 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CpdO89001 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CpdO89001 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CpdO89001 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CpdO89001 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CpdO89001 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CpdO89001 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CpdO89001 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CpdO89001 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CpdO89001 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CpdO89001 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CpdO89001 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CpdO89001 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CpdO89001 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CpdO89001 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CpdO89001 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CpdO89001 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CpdO89001 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CpdO89001 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CpdO89001 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CpdO89001 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CpdO89001 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CpdO89001 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CpdO89001 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CpdO89001 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CpdO89001 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CpdO89001 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CpdO89001 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CpdO89001 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CpdO89001 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CpdO89001 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CpdO89001 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CpdO89001 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CpdO89001 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CpdO89001 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CpdO89001 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CpdO89001 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CpdO89001 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CpdO89001 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CpdO89001 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CpdO89001 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CpdO89001 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CpdO89001 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CpdO89001 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CpdO89001 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CpdO89001 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CpdO89001 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms