Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms