Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnkO88874 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnkO88874 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnkO88874 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnkO88874 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnkO88874 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms