Protein–RNA interactions for Protein: O88848

Arl6, ADP-ribosylation factor-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6O88848 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl6O88848 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl6O88848 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl6O88848 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl6O88848 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl6O88848 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl6O88848 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6O88848 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6O88848 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms