Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
F11rO88792 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
F11rO88792 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
F11rO88792 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F11rO88792 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
F11rO88792 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F11rO88792 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F11rO88792 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F11rO88792 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F11rO88792 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F11rO88792 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
F11rO88792 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F11rO88792 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
F11rO88792 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
F11rO88792 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
F11rO88792 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
F11rO88792 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
F11rO88792 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
F11rO88792 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
F11rO88792 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
F11rO88792 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
F11rO88792 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
F11rO88792 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
F11rO88792 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
F11rO88792 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
F11rO88792 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
F11rO88792 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
F11rO88792 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
F11rO88792 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
F11rO88792 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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