Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tom1O88746 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1O88746 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1O88746 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1O88746 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1O88746 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1O88746 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1O88746 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1O88746 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1O88746 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1O88746 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms