Protein–RNA interactions for Protein: O88627

Slc28a2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a2O88627 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a2O88627 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms