Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sap30O88574 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sap30O88574 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sap30O88574 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sap30O88574 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sap30O88574 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Sap30O88574 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sap30O88574 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sap30O88574 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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