Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms