Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme6O88425 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme6O88425 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme6O88425 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme6O88425 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme6O88425 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms