Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms