Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnnt1O88346 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms