Protein–RNA interactions for Protein: O88324

Cd83, CD83 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd83O88324 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd83O88324 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd83O88324 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd83O88324 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd83O88324 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd83O88324 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms