Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nid2O88322 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nid2O88322 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nid2O88322 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nid2O88322 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nid2O88322 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nid2O88322 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nid2O88322 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nid2O88322 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms