Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CtssO70370 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CtssO70370 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CtssO70370 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtssO70370 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtssO70370 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtssO70370 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CtssO70370 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtssO70370 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtssO70370 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtssO70370 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtssO70370 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtssO70370 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtssO70370 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtssO70370 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtssO70370 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CtssO70370 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtssO70370 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CtssO70370 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CtssO70370 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtssO70370 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtssO70370 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtssO70370 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CtssO70370 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtssO70370 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtssO70370 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtssO70370 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtssO70370 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtssO70370 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtssO70370 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtssO70370 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtssO70370 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtssO70370 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtssO70370 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtssO70370 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtssO70370 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtssO70370 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtssO70370 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtssO70370 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtssO70370 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtssO70370 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtssO70370 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtssO70370 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtssO70370 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtssO70370 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtssO70370 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtssO70370 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtssO70370 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtssO70370 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtssO70370 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtssO70370 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtssO70370 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtssO70370 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtssO70370 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtssO70370 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtssO70370 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtssO70370 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtssO70370 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtssO70370 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtssO70370 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtssO70370 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtssO70370 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtssO70370 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtssO70370 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtssO70370 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtssO70370 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtssO70370 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtssO70370 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtssO70370 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtssO70370 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtssO70370 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtssO70370 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtssO70370 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtssO70370 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtssO70370 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtssO70370 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtssO70370 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtssO70370 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtssO70370 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtssO70370 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CtssO70370 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CtssO70370 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtssO70370 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms