Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxq1O70220 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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