Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AurkbO70126 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AurkbO70126 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AurkbO70126 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkbO70126 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AurkbO70126 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AurkbO70126 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AurkbO70126 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AurkbO70126 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AurkbO70126 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AurkbO70126 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AurkbO70126 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AurkbO70126 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
AurkbO70126 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AurkbO70126 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AurkbO70126 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms