Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd70O55237 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd70O55237 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd70O55237 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd70O55237 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd70O55237 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd70O55237 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd70O55237 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd70O55237 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd70O55237 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd70O55237 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd70O55237 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd70O55237 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd70O55237 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd70O55237 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd70O55237 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd70O55237 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd70O55237 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd70O55237 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd70O55237 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd70O55237 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd70O55237 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd70O55237 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd70O55237 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd70O55237 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms