Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad51dO55230 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms