Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChkbO55229 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChkbO55229 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChkbO55229 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ChkbO55229 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChkbO55229 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChkbO55229 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChkbO55229 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ChkbO55229 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms