Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nipsnap1O55125 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Nipsnap1O55125 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap1O55125 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms