Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg2O55111 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms