Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr1O55100 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngr1O55100 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms