Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn20O55082 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms