Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna1bO55017 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna1bO55017 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms