Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlkO54988 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlkO54988 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlkO54988 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlkO54988 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlkO54988 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SlkO54988 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlkO54988 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlkO54988 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlkO54988 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlkO54988 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlkO54988 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlkO54988 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlkO54988 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlkO54988 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlkO54988 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlkO54988 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlkO54988 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlkO54988 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlkO54988 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlkO54988 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlkO54988 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlkO54988 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlkO54988 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlkO54988 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlkO54988 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlkO54988 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlkO54988 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SlkO54988 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlkO54988 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlkO54988 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlkO54988 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlkO54988 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlkO54988 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlkO54988 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlkO54988 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlkO54988 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlkO54988 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlkO54988 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlkO54988 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SlkO54988 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SlkO54988 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SlkO54988 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SlkO54988 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SlkO54988 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SlkO54988 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SlkO54988 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SlkO54988 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SlkO54988 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SlkO54988 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SlkO54988 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SlkO54988 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SlkO54988 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SlkO54988 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SlkO54988 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SlkO54988 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SlkO54988 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SlkO54988 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SlkO54988 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SlkO54988 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SlkO54988 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SlkO54988 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SlkO54988 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SlkO54988 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SlkO54988 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SlkO54988 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SlkO54988 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SlkO54988 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SlkO54988 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SlkO54988 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SlkO54988 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SlkO54988 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SlkO54988 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SlkO54988 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SlkO54988 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SlkO54988 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SlkO54988 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SlkO54988 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SlkO54988 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SlkO54988 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SlkO54988 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SlkO54988 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SlkO54988 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SlkO54988 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SlkO54988 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SlkO54988 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SlkO54988 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SlkO54988 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SlkO54988 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SlkO54988 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SlkO54988 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SlkO54988 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SlkO54988 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SlkO54988 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SlkO54988 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SlkO54988 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SlkO54988 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SlkO54988 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SlkO54988 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SlkO54988 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms