Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole2O54956 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole2O54956 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole2O54956 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms