Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp10aO54827 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp10aO54827 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp10aO54827 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp10aO54827 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp10aO54827 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp10aO54827 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp10aO54827 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp10aO54827 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp10aO54827 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp10aO54827 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp10aO54827 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp10aO54827 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp10aO54827 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp10aO54827 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp10aO54827 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp10aO54827 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp10aO54827 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp10aO54827 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp10aO54827 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp10aO54827 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp10aO54827 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp10aO54827 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp10aO54827 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp10aO54827 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp10aO54827 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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