Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffbO54788 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffbO54788 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffbO54788 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffbO54788 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffbO54788 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffbO54788 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffbO54788 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffbO54788 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffbO54788 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffbO54788 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffbO54788 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffbO54788 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffbO54788 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffbO54788 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffbO54788 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffbO54788 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffbO54788 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffbO54788 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffbO54788 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffbO54788 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffbO54788 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffbO54788 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffbO54788 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffbO54788 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffbO54788 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffbO54788 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffbO54788 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffbO54788 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffbO54788 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffbO54788 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DffbO54788 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DffbO54788 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DffbO54788 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DffbO54788 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DffbO54788 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DffbO54788 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DffbO54788 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DffbO54788 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DffbO54788 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DffbO54788 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DffbO54788 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DffbO54788 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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DffbO54788 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DffbO54788 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DffbO54788 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DffbO54788 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DffbO54788 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DffbO54788 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DffbO54788 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DffbO54788 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DffbO54788 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DffbO54788 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DffbO54788 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DffbO54788 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DffbO54788 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DffbO54788 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffbO54788 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffbO54788 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffbO54788 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffbO54788 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffbO54788 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffbO54788 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffbO54788 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffbO54788 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
DffbO54788 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
DffbO54788 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffbO54788 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffbO54788 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffbO54788 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffbO54788 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffbO54788 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffbO54788 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffbO54788 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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