Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccr6O54689 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms