Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnd2O35927 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms