Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cited2O35740 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cited2O35740 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cited2O35740 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cited2O35740 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cited2O35740 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms