Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PnnO35691 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PnnO35691 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PnnO35691 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PnnO35691 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PnnO35691 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PnnO35691 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PnnO35691 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PnnO35691 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PnnO35691 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PnnO35691 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PnnO35691 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PnnO35691 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PnnO35691 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PnnO35691 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PnnO35691 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PnnO35691 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PnnO35691 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PnnO35691 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PnnO35691 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnnO35691 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnnO35691 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnnO35691 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnnO35691 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnnO35691 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnnO35691 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnnO35691 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnnO35691 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnnO35691 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PnnO35691 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PnnO35691 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnnO35691 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnnO35691 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnnO35691 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnnO35691 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnnO35691 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnnO35691 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PnnO35691 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PnnO35691 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PnnO35691 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PnnO35691 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PnnO35691 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PnnO35691 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PnnO35691 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PnnO35691 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnnO35691 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnnO35691 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnnO35691 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnnO35691 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnnO35691 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnnO35691 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnnO35691 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnnO35691 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnnO35691 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnnO35691 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnnO35691 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnnO35691 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnnO35691 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PnnO35691 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PnnO35691 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PnnO35691 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnnO35691 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnnO35691 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnnO35691 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnnO35691 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnnO35691 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnnO35691 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnnO35691 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnnO35691 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnnO35691 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnnO35691 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnnO35691 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnnO35691 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnnO35691 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PnnO35691 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnnO35691 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnnO35691 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnnO35691 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnnO35691 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PnnO35691 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PnnO35691 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PnnO35691 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PnnO35691 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PnnO35691 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PnnO35691 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PnnO35691 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PnnO35691 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PnnO35691 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PnnO35691 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PnnO35691 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PnnO35691 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PnnO35691 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PnnO35691 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PnnO35691 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PnnO35691 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PnnO35691 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PnnO35691 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PnnO35691 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PnnO35691 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PnnO35691 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms