Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc27a2O35488 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc27a2O35488 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms