Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edil3O35474 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edil3O35474 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edil3O35474 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edil3O35474 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Edil3O35474 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edil3O35474 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Edil3O35474 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edil3O35474 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edil3O35474 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edil3O35474 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edil3O35474 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms