Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Prrt1O35449 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Prrt1O35449 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Prrt1O35449 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Prrt1O35449 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrt1O35449 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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